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近万例银屑病患者,1320个基因分析,他和团队绘制出中国人群蛋白截断突变图谱

 

近日,通过对近万例银屑病患者及对照样本1320个基因的深度测序与分析,首个大规模中国人群蛋白截断突变图谱被成功绘制。该研究由安徽医科大学第一附属医院皮肤科、安徽医科大学皮肤病研究所和皮肤病学教育部重点实验室孙良丹教授团队完成,并揭示了此类突变对银屑病发病机制的重要影响,为复杂疾病的遗传机制研究和治疗干预提供了新的思路。

 
 

蛋白截断突变(protein-truncating variant,PTV)是指基因组中包含的终止密码子、移码或剪接位点突变等一系列严重影响蛋白编码基因完整性和功能的遗传变异,对于人类表型多样性及疾病的发生发展有着重要意义。由于特定PTV在人群中的频率通常极低,且具有较高的人群特异性,对其进行分析需要特定的大样本人群数据及可靠的分析技术,在本研究之前尚未有公开的中国人群PTV图谱。

 
 

此次研究深入分析了10539名健康对照者和9434名银屑病患者中1320个基因上的PTVs特征,共鉴定了8720个PTV,其中77%是之前从未报道过的,显示其高度的人群特异性研究人员通过新型算法,发现88%的PTV是有害的且受到净化选择的影响,显示了自然选择对人类遗传变异的塑造与影响。研究还对所有鉴定得到的PTV进行了详细的分类与解析,据此绘制了首个中国人群蛋白截断突变图谱,完善了该领域的“中国拼图”。该研究发现,与对照组相比银屑病患者携带的PTV更多(P=0.02),显示其对疾病发生机制的重要影响。研究人员还通过对中、欧、非三大人群的比较,鉴定出18个在不同人群中分化水平极高的PTV,并推测其可能受到正向选择作用,进一步凸显了PTV的人群特异性特征。

 
 

本次研究构建中国人群蛋白截断突变图谱,进一步丰富了银屑病遗传变异基础,扩展了对于蛋白截断变异人群特异性的认识,对中国人群的起源与演化以及疾病遗传机制的研究具有重要意义。

 
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主办单位 / 安徽医科大学第一附属医院
素材/孙林 程梦明   编辑/李娟娟